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CRISPR检测服务

服务详情

交付标准 靶标质粒、crRNA、RPA恒温扩增引物、结题报告、50个反应的试剂CRISPR配套试剂盒
应用领域 1.疾病检测
2.食品安全
3.动物疫病
4.环境检测
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FASST快速检测平台

FASST(Fast, accurate, specific, and simple test)是⼀种基于CRISPR检测开发的下⼀代⾼灵敏度、⾼特异性、快速恒温的单管核酸检测技术。FASST依靠多种酶类在常温下协同作⽤,实现核酸的快速扩增和检测,具有双重特异性和双重信号放大优点,是真正的POCT技术。
 
传统CRISPR检测主要包括两管反应和单管反应两种形式。其中,两管反应操作复杂、易受污染;单管反应虽然简便且污染风险小,但灵敏度低、耗时。FASST技术基于球盟会生物基因自主开发的蛋白质纯化平台,顺利获得优化升级Cas酶结构,采用独特的crRNA设计逻辑,生产高效crRNA以及reporter,形成单管反应检测,在降低污染风险的情况下,将检测限提高到amol级别,将检测时间缩短至十分钟,实现了灵敏特异、快速准确的核酸检测,解决了传统CRISPR检测的痛点。
 
 
 
原理图

技术优势

技术对比

项 目 FASST PCR LAMP等恒温扩增 传统CRISPR检测

反应温度

37-42℃ 恒温

95℃-55℃-72℃ 变温

65℃ 恒温

37-42℃ 恒温

运行时间 5-20 mins 1-2h 40-60mins 30-60 mins

引物数量

2条

2条

4-6条

2条

试剂状态 液体/冻干 液体 液体 液体/冻干
设备要求 恒温设备(金属浴,水浴等) PCR扩增仪 恒温设备 恒温设备(金属浴,水浴等)
操作性 操作极为简单可实现 真正意义上的便携 专业操作要求,高设备操作复杂 操作简单 操作极为简单 可实现真正意义上的便携
气溶胶污染 单管反应,污染风险低 存在气溶胶污染风险 存在气溶胶污染风险 两管反应,存在气溶胶污染风险

球盟会生物基因可提供服务

球盟会生物基因基于CRISPR检测开发的高灵敏度、高特异性、快速恒温核酸检测技术——FASST快速检测技术,解决了传统CRISPR检测中存在的问题,如操作复杂、易污染、灵敏度低和耗时长。顺利获得自主开发的蛋白质纯化平台优化Cas酶结构,开发特有的crRNA设计逻辑,生产高效crRNA,并使用自主设计的reporter,实现更高灵敏检测,简化操作步骤,减少污染风险。可根据您的实验需求选择:分步定制或全套定制检测服务。

服务内容与交付标准

服务内容 服务说明 交付标准

制备靶标基因模板

合成靶标质粒 靶标质粒
crRNA和RPA恒温扩增引物的设计与合成 根据靶标序列设计crRNA和RPA引物 crRNA,2 OD
RPA恒温扩增引物的活性筛选 多对RPA引物分别扩增靶标序列,确认效率最好的引物对 RPA恒温扩增引物,2 OD
crRNA的活性筛选 多条crRNA进行活性分析,确认效率最好的crRNA 结题报告与原始数据
crRNA和RPA恒温扩增引物的实验体系建立和优化 对RPA引物对和crRNA的最佳组合进行灵敏度测试、特异性测试和准确性测试 结题报告与原始数据
FASST检测整套服务 / 结题报告,50个反应的试剂CRISPR配套试剂盒

实验流程

应用案例

① 非洲猪瘟病毒检测
结果:使用ASFV 1070检测非洲猪瘟病毒,CRISPR/Cas12a一管法检测技术可在10min内检测到100 copies的核酸;可在20min内检测到10-50 copies的核酸。
 
 
 
② 鹦鹉博尔纳病毒检测
结果:CRISPR/Cas12a两管法检测技术(RPA反应30min,CRISPR检测10min)可在40min内检测到10 copies的鹦鹉博尔纳病毒核酸。
 
 
 
③ 流产布鲁杆菌检测
结果: CRISPR/Cas12a两管法检测技术(RPA反应30min,CRISPR检测10min)可在40min内检测到100 copies的流产布鲁杆菌核酸。
 

Advantage and Characteristic

Optimazied Strategy
We have create a unique sgRNA Design Logic
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精选客户文章

IF=50.5
nature

全球超过一半的肝细胞癌(HCC)病例发生在中国,但现在针对中国人群中乙型肝炎病毒(HBV)相关HCC的全基因组分析研究非常有限。为了突破这种限制,研究人员启动了“中国肝癌图谱项目”(CLCA),旨在对中国人群中的HCC进行大规模的全基因组分析以理解其独特的发病机制和进化过程。该项目对494例HCC肿瘤样本进行了深度全基因组测序(平均测序深度为120×),并分析了匹配的对照血液样本,揭示了HBV相关HCC的详细基因组特征。研究发现,除了已知的编码区驱动基因(如TP53和CTNNB1)外,还存在6个新的编码区驱动基因(包括FGA)和31个非编码区驱动基因。此外,研究还揭示5种新的突变特征(包括SBS_H8),以及HBV整合形成细胞外环状DNA(ecDNA)的现象,这些ecDNA可导致癌基因扩增和表达增加。顺利获得功能验证实验,研究人员证实了FGA、PPP1R12B和KCNJ12等基因的突变能够显著影响HCC细胞的增殖、迁移和侵袭能力。这项研究结果不仅丰富了人们对HCC基因组学的理解,也为HCC的诊断和治疗提供了新的潜在靶点。

候选驱动因子概况

IF=27.4
Advanced material

肌腱损伤急性炎症期中,巨噬细胞过度激活会导致编码骨桥蛋白OPN的SPP1过表达,影响组织再生。CRISPR-Cas13由于具有RNA编辑和快速降解的能力,在组织修复方面具有巨大潜力,但缺乏合适有效的递送方法。对此,研究人员系统筛选了针对巨噬细胞的阳离子聚合物,开发了一种能够高效递送Cas13核糖核蛋白复合物(Cas13 RNP)进入巨噬细胞的纳米簇载体。顺利获得反应性氧种(ROS)响应性释放机制,该系统能够在肌腱损伤的急性炎症微环境中特异性抑制巨噬细胞中SPP1的过表达。实验结果表明,这种靶向策略显著减少了损伤诱导的SPP1产生巨噬细胞的出现,降低了成纤维细胞的激活,并减轻了肌腱周围的粘连形成。此外,该研究还揭示了SPP1顺利获得CD44/AKT信号通路促进成纤维细胞活化和迁移的机制,并顺利获得抑制这一通路有效缓解了肌腱损伤后的粘连问题。

用于PA治疗的巨噬细胞免疫微环境激活mRNA编辑策略的示意图

IF=12.8
Biomaterials

脊髓损伤(SCI)是一种导致感觉自主神经和运动功能的永久性损害的严重致残性疾病。干细胞疗法,尤其是间充质干细胞(MSCs),在SCI治疗中展现出巨大潜力但其再生能力有限,这限制了其在组织再生中的应用。研究团队观察到ABPCs衍生的EVs(EVsABPC)可能携带促进组织再生的生物活性信号,因此他们从鹿角芽基祖细胞(ABPCs)中提取并修饰了细胞外囊泡(EVsABPC),并将其应用于脊髓损伤(SCI)的治疗研究。研究人员发现EVsABPC能够显著增强神经干细胞(NSCs)的增殖,促进轴突生长,减少神经元凋亡,并顺利获得调节炎症反应将巨噬细胞从促炎的M1型极化为抗炎的M2型。此外,经过工程化改造的EVsABPC(顺利获得激活细胞穿透肽修饰)能够更有效地靶向SCI损伤部位,显著改善神经再生和运动功能恢复。这些结果表明,EVsABPC是一种极具潜力的SCI治疗候选方案。

图解摘要

IF=12.2
Journal of Hazardous Materials

S-异丙甲草胺(S-MET)是我国生产和使用量最大的除草剂之一,其化学特性导致其可在土壤中持久存在以及容易顺利获得淋溶和沉降污染地表水和地下水,最终影响植物生长和顺利获得食物链危害人类生命健康。鉴于现有检测方法的局限性和对高效分析技术的迫切需求,该研究以S-metolachlor为对象,利用哺乳动物表达系统生成相关重组抗体。在成功表达抗体的基础上,成功建立了基于这些抗体的免疫分析方法,用于监测环境水样中的S-异丙甲草胺残留。icELISA结果显示,重组抗体的灵敏度和特异性与亲本单抗相似,可保持原有的生物学活性,对于江水、农田水和自来水中的S-MET,具有良好的准确性和重复性。

图解摘要

IF=10.7
Biosensors and Bioelectronics

微小RNA(miRNA)是一类小的非编码RNA分子,顺利获得与特定靶基因的信使RNA(mRNA)相互作用来调控基因表达。miRNA在多种疾病的发生、开展过程中扮演着重要角色,被认为是极具潜力的疾病生物标志物。该研究利用CRISPR/Cas12a开发了一种为DBmRCA的新型miRNA检测技术。该技术利用无连接酶的哑铃探针和高灵敏度的CRISPR/Cas12a信号输出策略,实现了在30分钟内对miRNA的高精度定量分析。研究团队顺利获得临床样本验证了该技术的有效性,发现miR-200a和miR-126在肺癌组织中的表达水平显著降低,且该技术与传统方法结果一致。DBmRCA技术具有时间效率高、灵敏度强和操作流程简化等优点,为临床miRNA分析提供了一种可靠的工具,有望助力肺癌的早期诊断和治疗。

图解摘要

参考文献

DOI:10.1038/s41586-024-07054-3

全球超过一半的肝细胞癌(HCC)病例发生在中国,但现在针对中国人群中乙型肝炎病毒(HBV)相关HCC的全基因组分析研究非常有限。为了突破这种限制,研究人员启动了“中国肝癌图谱项目”(CLCA),旨在对中国人群中的HCC进行大规模的全基因组分析以理解其独特的发病机制和进化过程。该项目对494例HCC肿瘤样本进行了深度全基因组测序(平均测序深度为120×),并分析了匹配的对照血液样本,揭示了HBV相关HCC的详细基因组特征。研究发现,除了已知的编码区驱动基因(如TP53和CTNNB1)外,还存在6个新的编码区驱动基因(包括FGA)和31个非编码区驱动基因。此外,研究还揭示5种新的突变特征(包括SBS_H8),以及HBV整合形成细胞外环状DNA(ecDNA)的现象,这些ecDNA可导致癌基因扩增和表达增加。顺利获得功能验证实验,研究人员证实了FGA、PPP1R12B和KCNJ12等基因的突变能够显著影响HCC细胞的增殖、迁移和侵袭能力。这项研究结果不仅丰富了人们对HCC基因组学的理解,也为HCC的诊断和治疗提供了新的潜在靶点。

候选驱动因子概况

DOI:10.1002/adma.202311964

肌腱损伤急性炎症期中,巨噬细胞过度激活会导致编码骨桥蛋白OPN的SPP1过表达,影响组织再生。CRISPR-Cas13由于具有RNA编辑和快速降解的能力,在组织修复方面具有巨大潜力,但缺乏合适有效的递送方法。对此,研究人员系统筛选了针对巨噬细胞的阳离子聚合物,开发了一种能够高效递送Cas13核糖核蛋白复合物(Cas13 RNP)进入巨噬细胞的纳米簇载体。顺利获得反应性氧种(ROS)响应性释放机制,该系统能够在肌腱损伤的急性炎症微环境中特异性抑制巨噬细胞中SPP1的过表达。实验结果表明,这种靶向策略显著减少了损伤诱导的SPP1产生巨噬细胞的出现,降低了成纤维细胞的激活,并减轻了肌腱周围的粘连形成。此外,该研究还揭示了SPP1顺利获得CD44/AKT信号通路促进成纤维细胞活化和迁移的机制,并顺利获得抑制这一通路有效缓解了肌腱损伤后的粘连问题。

用于PA治疗的巨噬细胞免疫微环境激活mRNA编辑策略的示意图

DOI:10.1016/j.biomaterials.2022.121990

脊髓损伤(SCI)是一种导致感觉自主神经和运动功能的永久性损害的严重致残性疾病。干细胞疗法,尤其是间充质干细胞(MSCs),在SCI治疗中展现出巨大潜力但其再生能力有限,这限制了其在组织再生中的应用。研究团队观察到ABPCs衍生的EVs(EVsABPC)可能携带促进组织再生的生物活性信号,因此他们从鹿角芽基祖细胞(ABPCs)中提取并修饰了细胞外囊泡(EVsABPC),并将其应用于脊髓损伤(SCI)的治疗研究。研究人员发现EVsABPC能够显著增强神经干细胞(NSCs)的增殖,促进轴突生长,减少神经元凋亡,并顺利获得调节炎症反应将巨噬细胞从促炎的M1型极化为抗炎的M2型。此外,经过工程化改造的EVsABPC(顺利获得激活细胞穿透肽修饰)能够更有效地靶向SCI损伤部位,显著改善神经再生和运动功能恢复。这些结果表明,EVsABPC是一种极具潜力的SCI治疗候选方案。

图解摘要

DOI:10.1016/j.jhazmat.2021.126305

S-异丙甲草胺(S-MET)是我国生产和使用量最大的除草剂之一,其化学特性导致其可在土壤中持久存在以及容易顺利获得淋溶和沉降污染地表水和地下水,最终影响植物生长和顺利获得食物链危害人类生命健康。鉴于现有检测方法的局限性和对高效分析技术的迫切需求,该研究以S-metolachlor为对象,利用哺乳动物表达系统生成相关重组抗体。在成功表达抗体的基础上,成功建立了基于这些抗体的免疫分析方法,用于监测环境水样中的S-异丙甲草胺残留。icELISA结果显示,重组抗体的灵敏度和特异性与亲本单抗相似,可保持原有的生物学活性,对于江水、农田水和自来水中的S-MET,具有良好的准确性和重复性。

图解摘要

DOI:10.1016/j.bios.2024.116676

微小RNA(miRNA)是一类小的非编码RNA分子,顺利获得与特定靶基因的信使RNA(mRNA)相互作用来调控基因表达。miRNA在多种疾病的发生、开展过程中扮演着重要角色,被认为是极具潜力的疾病生物标志物。该研究利用CRISPR/Cas12a开发了一种为DBmRCA的新型miRNA检测技术。该技术利用无连接酶的哑铃探针和高灵敏度的CRISPR/Cas12a信号输出策略,实现了在30分钟内对miRNA的高精度定量分析。研究团队顺利获得临床样本验证了该技术的有效性,发现miR-200a和miR-126在肺癌组织中的表达水平显著降低,且该技术与传统方法结果一致。DBmRCA技术具有时间效率高、灵敏度强和操作流程简化等优点,为临床miRNA分析提供了一种可靠的工具,有望助力肺癌的早期诊断和治疗。

图解摘要

FAQ

如何提高Cas酶的检测灵敏度?
1)设计高效的crRNA序列。顺利获得合理的设计以及在线网站结构预测,选择合适的crRNA,以取得良好的Cas酶反式切割活性。
2)选择合适的信号报告底物。有关研究指出,使用15 nt的单链DNA(ssDNA)作为报告底物时,Cas12a的切割反应速率达到最大值,相较于常用的5-nt ssDNA,反应速率显著提升。
3)优化反应条件和缓冲液。顺利获得优化CRISPR反应的条件如Cas酶与crRNA比例、Cas酶使用浓度、反应温度等可以在一定程度上提高检测效果。
可根据以下步骤进行设计
1)明确目的基因序列。
2)明确使用的Cas蛋白。不同的Cas蛋白,需要识别相应的PAM(Protospacer Adjacent Motif)序列,例如Cas12a需要依靠“TTTV”PAM序列进行靶标识别。
3)选择crRNA靶向区域。在目标基因上选择一个20nt核苷酸序列,该序列紧邻PAM位点,且与crRNA的互补链配对。
4)选定的20nt靶向区域作为 target sequence(可变部分)加上scaffold sequence (固定部分)以设计crRNA序列。
5)使用在线工具如CRISPR design tool(例如CRISPOR、 Benchling等)来帮助设计crRNA。这些工具可以预测sgRNA的效率和特异性,避免可能的脱靶效应。
6)设计完成后,可以顺利获得合成生物学公司订购合成的crRNA序列。

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